Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY2

Tarsl2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarsl2Q8BLY2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarsl2Q8BLY2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tarsl2Q8BLY2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms