Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc9Q8BJN4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms