Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rspo4Q8BJ73 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms