Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Katnb1Q8BG40 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms