Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl42Q8BFQ9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl42Q8BFQ9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms