Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg4cQ811C2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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