Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc27Q80YS5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Lrrc27Q80YS5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Lrrc27Q80YS5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Lrrc27Q80YS5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Lrrc27Q80YS5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Lrrc27Q80YS5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Lrrc27Q80YS5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Lrrc27Q80YS5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Lrrc27Q80YS5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Lrrc27Q80YS5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Lrrc27Q80YS5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc27Q80YS5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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