Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll4Q80UG8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttll4Q80UG8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttll4Q80UG8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttll4Q80UG8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttll4Q80UG8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttll4Q80UG8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttll4Q80UG8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttll4Q80UG8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttll4Q80UG8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttll4Q80UG8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttll4Q80UG8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms