Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otop3Q80UF9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Otop3Q80UF9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Otop3Q80UF9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Otop3Q80UF9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Otop3Q80UF9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otop3Q80UF9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otop3Q80UF9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otop3Q80UF9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otop3Q80UF9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otop3Q80UF9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otop3Q80UF9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otop3Q80UF9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otop3Q80UF9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otop3Q80UF9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otop3Q80UF9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms