Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep170bQ80U49 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep170bQ80U49 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms