Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctdp1Q7TSG2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdp1Q7TSG2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms