Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dsg1bQ7TSF1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms