Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ckap2lQ7TS74 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ckap2lQ7TS74 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms