Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms