Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMY7

Ipo8, Importin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,010 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo8Q7TMY7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ipo8Q7TMY7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ipo8Q7TMY7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ipo8Q7TMY7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ipo8Q7TMY7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ipo8Q7TMY7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ipo8Q7TMY7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ipo8Q7TMY7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ipo8Q7TMY7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ipo8Q7TMY7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ipo8Q7TMY7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ipo8Q7TMY7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ipo8Q7TMY7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ipo8Q7TMY7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ipo8Q7TMY7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ipo8Q7TMY7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ipo8Q7TMY7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ipo8Q7TMY7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms