Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed3Q78IS1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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