Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp34Q6ZQ93 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp34Q6ZQ93 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms