Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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Chsy1Q6ZQ11 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Chsy1Q6ZQ11 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chsy1Q6ZQ11 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms