Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3F0

P4ha3, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha3Q6W3F0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P4ha3Q6W3F0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P4ha3Q6W3F0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms