Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tfap2eQ6VUP9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2eQ6VUP9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2eQ6VUP9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2eQ6VUP9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2eQ6VUP9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2eQ6VUP9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2eQ6VUP9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2eQ6VUP9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms