Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja6Q6S5G4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja6Q6S5G4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms