Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmeff1Q6PFE7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms