Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtifQ6PEE2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms