Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdgfrlQ6PE55 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdgfrlQ6PE55 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms