Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SvoplQ6PDF3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms