Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc3bQ6PDC0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms