Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rexo4Q6PAQ4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rexo4Q6PAQ4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms