Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx6Q6P8X1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms