Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Smarca2Q6DIC0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms