Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgd6Q69ZL1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgd6Q69ZL1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgd6Q69ZL1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgd6Q69ZL1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgd6Q69ZL1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgd6Q69ZL1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgd6Q69ZL1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgd6Q69ZL1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgd6Q69ZL1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgd6Q69ZL1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fgd6Q69ZL1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fgd6Q69ZL1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fgd6Q69ZL1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fgd6Q69ZL1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fgd6Q69ZL1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fgd6Q69ZL1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fgd6Q69ZL1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Fgd6Q69ZL1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fgd6Q69ZL1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fgd6Q69ZL1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fgd6Q69ZL1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fgd6Q69ZL1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms