Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms