Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Tbr1Q64336 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Tbr1Q64336 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tbr1Q64336 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tbr1Q64336 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tbr1Q64336 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tbr1Q64336 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbr1Q64336 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tbr1Q64336 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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