Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CcncQ62447 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CcncQ62447 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CcncQ62447 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CcncQ62447 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CcncQ62447 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CcncQ62447 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CcncQ62447 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms