Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nptx1Q62443 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nptx1Q62443 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms