Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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