Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha6Q62413 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha6Q62413 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha6Q62413 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha6Q62413 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha6Q62413 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha6Q62413 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha6Q62413 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha6Q62413 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha6Q62413 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha6Q62413 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha6Q62413 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha6Q62413 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha6Q62413 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha6Q62413 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha6Q62413 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha6Q62413 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha6Q62413 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms