Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga6Q61739 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms