Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EsrrbQ61539 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EsrrbQ61539 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EsrrbQ61539 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EsrrbQ61539 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EsrrbQ61539 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EsrrbQ61539 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EsrrbQ61539 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EsrrbQ61539 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EsrrbQ61539 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EsrrbQ61539 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EsrrbQ61539 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EsrrbQ61539 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms