Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smarcd1Q61466 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms