Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd53Q61451 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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