Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1eQ61290 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1eQ61290 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1eQ61290 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1eQ61290 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1eQ61290 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1eQ61290 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1eQ61290 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1eQ61290 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms