Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
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Cln3Q61124 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
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Cln3Q61124 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
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Cln3Q61124 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln3Q61124 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln3Q61124 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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