Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms