Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms