Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms