Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcf4Q60722 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcf4Q60722 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms