Protein–RNA interactions for Protein: Q60716

P4ha2, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha2Q60716 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P4ha2Q60716 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha2Q60716 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms