Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sik1Q60670 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sik1Q60670 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms