Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sema5bQ60519 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema5bQ60519 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms