Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vmn1r195Q5SVD6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Vmn1r195Q5SVD6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Vmn1r195Q5SVD6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Vmn1r195Q5SVD6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Vmn1r195Q5SVD6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Vmn1r195Q5SVD6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Vmn1r195Q5SVD6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Vmn1r195Q5SVD6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Vmn1r195Q5SVD6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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